S6 Microorganismes-Environnement (BEE-219E)-MIC ENV

Ce module participe pour l'élaboration d'une spécialité en BEE (Biodiversité, Ecologie, Evolution)

Le module se focalise sur les microorganismes et leurs rôles fondamentaux dans le fonctionnement des écosystèmes aquatiques et terrestres, ainsi que la manière dont les changements globaux les affectent. Les principaux outils et méthodes de l'analyse de la diversité et de la fonction de ces microorganismes seront abordés.

Cours magistraux (10h) 

Microbiologie des habitats aquatiques et du sol 

Géomicrobiologie 

Sédiments d’origine biologique et leur formation, préservation 

Ecotoxicologie 

Travaux dirigés (3h) 

Travail sur articles 

Travaux pratiques (12h) 

Isolement, dénombrement et analyse de diversité de microorganismes dans l'environnement  

Microscopie de groupes sélectionnés de microorganismes 

Enrichissement de microorganismes (colonne de Winogradsky, infusion de foin etc.) 

Analyser des jeux de données sur la diversité, le fonctionnement et les interactions des microorganismes au sein de communautés. 

Appliquer un diagnostic environnemental et une analyse de dysfonctionnements dans les écosystèmes à partir des microorganismes 

Mobiliser des approches de valorisation de microorganismes comme indicateur de la qualité de l'environnement et pour la bioremédiation.   

Appliquer les méthodes classiques de caractérisation des microorganismes à partir d’échantillon environnementaux 

Bloc 1 : Contextualiser une problématiiue scientifique
Bloc 3 : Collecter les données - Décrire le système biologique