S4 Ecologie : Evolution 2 (BEE-209)-EVOL2

Ce module participe pour l'élaboration d'une spécialité en 

SVT ME (Métiers de l'Enseignement en SVT)

La compréhension des processus évolutifs impliqués dans la formation de la diversité des espèces à différentes échelles spatio-temporelles est crucial afin d’identifier le rôle de la sélection, de l’adaptation et des traits d’histoire de vie dans la promotion de la diversification. En utilisant des approches phylogénétiques, les objectifs de cet UE  sont de (i) connaitre les différents modes de spéciation et s’initier à l’identification des facteurs promoteurs de la diversité, (ii) comprendre l’importance des interactions des traits biotiques et abiotiques au cours de l’histoire évolutive des espèces et (iii) s’initier aux approches phylogénétiques et phylogéographiques pour l’étude des dynamiques évolutives et de la spéciation.  

Programme :

Cours magistraux (11h) 

Notions d’espèces, modes de spéciation (parapatry, sympatry, allopatry...etc)  

Phylogéographie: définition, patterns, introductions aux modèles de coalescence  

Phylogénie moléculaire : principes, concepts et applications en systématique  

Modèles de radiations: conservatisme de niche 

Interactions traits biotiques et abiotique 

Introduction à la génomique évolutive (évolution des génomes, éléments transposables, polyploïdie, théorie endosymbiotique…)  

Travaux dirigés (6h) 

TD forces évolutives inter-échelles  (analyse d’un article interactions structure populations-taux de speciation)  TD spéciation:  continuum biologique, évolution en action, nécessité de déterminer des catégories (sous-espèces, variétés...etc), introduction à la nomenclature   

Travaux pratiques (8h) 

TP Introduction à la phylogénétique à l’aide d’outils bioinformatiques (modèles d’inférences phylogénétiques, manipuler/éditer arbres phylogénétiques, mapper habitats et traits fonctionnels)  

Evolution 1, Outils d’analyse de séquence d’acide nucléique , Biostatistiques  2 et 3

Bloc 1 : Contextualiser une problématiiue scientifique
Bloc 4 : Analyser les données