S6 REPEM Reconnaissance entre protéines et petites molécules (BBM-224E)

participe du parcours BBM

Résumé 

Ce module aborde des notions fondamentales des interactions réversibles protéines-petites molécules et les conséquences physiopathologiques de la perturbation de ces interactions pour une grande variété de fonctions cellulaires (les réactions enzymatiques, la catalyse, la transduction du signal et la régulation de nombreuses réactions métaboliques). Les informations essentielles sur la fixation et le mécanisme et la spécificité seront abordées pratiquement via l’étude des équilibres d’association protéine-petites molécules : mesures de l’affinité de fixation (binding) et de la stœchiométrie de la liaison entre ligands et macromolécules, et détermination du nombre de sites de fixation. 

Programme :

Cours magistraux

1. Principes de l’interaction protéine-ligand 

2. Conséquences physiopathologiques des perturbations des interactions protéine-ligand 

3. Techniques d’études des interactions protéine-ligand (chromatographie, spectroscopie, dialyse à l’équilibre, plasmon de surface) 

Travaux dirigés :

Scatchard, détermination du nombre de sites de fixation et de la constante d’association. Exercices sur les techniques d’études des interactions protéine-ligand (interprétation de chromatogrammes, spectres de différence, dosage du ligand) 

Travaux pratiques :

1. Etude d’interaction Protéine-Ligand par chromatographie d’exclusion sur gel (BSA-PSP) - 4h 

2. Détermination du nombre de sites actifs de la trypsine – 4h 

3. Application de l’interaction protéine-ligand à la purification de protéine par chromatographie d’affinité – 4h 

Maîtriser et mobiliser les concepts fondamentaux des Interactions protéines et petites molécules 

Comprendre l’importance physiologique des interactions protéines-petites molécules et les conséquences de leur perturbation  

Analyser et interpréter des données scientifiques  

Mobiliser des connaissances théoriques pour des applications expérimentales 

Appliquer les concepts théoriques  

Analyser des résultats expérimentaux pour tirer des conclusions 

Socle disciplinaire de S1, SPENZY ….

Bloc 1 : CONTEXTUALISER UNE PROBLEMATIQUE SCIENTIFIQUE
Bloc 3: COLLECTER L’INFORMATION/LA DONNEE BIOLOGIQUE-DECRIRE​