UE Recherche (UE du M1 Santé)

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- L’ontogénie du tissu hématopoïétique
-La cellule souche hématopoïétique, modèle de cellule souche tissulaire.
Identification, mécanismes gouvernant son auto-renouvellement et sa
différenciation.
-Les différentes voies de différenciation hématopoïétique : facteurs de
transcription de l’hématopoïèse, cytokines et récepteurs, voies de
signalisation, application à l’érythropoïèse, la mégacaryopoïèse, la
granulopoïèse, la monocytopoïèse, la lymphopoïèse B et T
- Les fonctions non hématopoïétiques des cellules sanguines : la
réparation tissulaire, l’angiogénèse, etc..
- Les pathologies congénitales de l’hématopoïèse : les hémolyses
constitutionnelles, la maladie de Blackfan Diamond, les neutropénies et
thrombopénies congénitales.
- les hémoglobinopathies héréditaires, drépanocytose, thalassémie
Les mécanismes de base de la leucémogénèse et leur spécificité dans
quelques affections choisies : leucémies aiguës myéloblastiques,
syndromes myéloprolifératifs, lymphome de Burkitt notamment
Le vieillissement cellulaire, l’hématopoïèse clonale

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L’objectif de cet enseignement est la compréhension des principales techniques d’imagerie fonctionnelle et moléculaire, des mécanismes biologiques et cellulaires qu’elles permettent d’explorer et de leurs applications cliniques.
L’enseignement magistral porte donc sur des rappels sur les principales techniques d’imagerie (médecine nucléaire, IRM, imagerie optique, imagerie préclinique), le développement de traceurs pour l’imagerie (agents de contraste, radiopharmaceutiques, traceurs multimodaux…), et enfin les différentes applications en routine et en recherche clinique, notamment dans le domaine de la cardiologie, l’oncologie, la neurologie, les maladies infectieuses.
Enfin l’enseignement dirigé comprend la réalisation d’un mémoire bibliographique et d’une présentation orale sur un sujet de recherche avec l’aide d’un enseignant responsable.

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THEORIQUE : Méthodologie-Techniques d’étude en biologie des
tumeurs
Introduction à la cancérologie Moderne :
Méthodologie en Biologie cellulaire et moléculaire
Methodologie en histologie
Méthodologie en immunologie
Genetique à haut débit
Analyse de la mort cellulaire
Interprétation de variation somatique
introduction à la lecture critique des articles en cancérologie
THEORIQUE : Grands concepts en biologie tumorale
Les voies de transduction du signal
Le cycle cellulaire
Oncogenèse notion d’oncogène antioncogène
Classification et nomenclature des tumeurs malignes
les grands principes de la réponse immunitaire anti tumorale
Angiogenèse tumorale : physiopathologie moléculaire et ciblage
thérapeutique (Pr S
Cancérogénèse virale et chimique
Tolérance et immunosurveillance
Le processus métastatique : aspects biologiques et conséquences
thérapeutiques
PRATIQUE :
TP sur la mort cellulaire
TP Cytometrie :
Théorique principe thérapeutique
Effet des chimiothérapies et de la radiothérapie sur la réponse immunitaire
antitumorale
Stratégies d’immunothérapie en cancérologie
Traiter de façon plus adaptée grâce à la biologie : exemple du cancer du sein
De l’anatomopathologie à la théranostique
Bases moléculaires de l’action des thérapeutiques ciblées
Bases moléculaires de l’action des radiations ionisantes. Grands principes
thérapeutiques :
Principes de pharmacologie générale:
Les anticorps monoclonaux et ADC
Bases Moléculaires de l’hormonothérapie en cancérologie
Pharmacogénétique
La chimiothérapie conventionnelle en cancérologie : Mécanismes d’action,
Mécanismes de réparation de l’ADN, et mécanismes de résistance.

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1. Première partie : fondamentale et préclinique
- Conception de nouvelles molécules actives
- Méthodes d'évaluation pré-clinique des molécules actives : Aspects
pharmacocinétiques
- Les modèles expérimentaux utilisés dans le développement pré-
clinique des molécules actives
- Méthodes d’évaluation pré-clinique des molécules actives : la
pharmacométrie
- Les modèles animaux utilisés en pharmacologie pré-clinique :
aspects éthiques
- Les modèles précliniques appliqués au développement de nouvelles
molécules actives : exemples de l’ischémie cérébrale, de
l’hypertension artérielle pulmonaire et de la fibrose pulmonaire et
du cancer.
2. Deuxième partie : Pharmacologie clinique, Surveillance post-AMM
des médicaments, Suivi thérapeutique et pharmacologique
- Relation PK-PD. Variabilité pharmacocinétique
- Relation PK-PD : modélisation pharmacocinétique et utilisation des
paramètres pharmacocinétiques à l’ajustement posologique / Suivi
thérapeutique et pharmacologique : exemples des antibiotiques et
des immunosuppresseurs.
- Méthodologie d'évaluation du médicament en vie réelle : Etudes de
cas et analyse d’articles
Rôles et organisation de la Pharmacovigilance : Etudes de cas

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UEA (1er semestre) – ENSEIGNEMENT THEORIQUE :
- Introduction sur les agents infectieux
- Facteurs de virulence et pathogénicité
- Déterminants de l'interaction Hôte-Pathogène
- Environnement, risque sanitaire et infections
- Epidémiologie moléculaire des infections
- Mécanismes de résistance aux molécules antimicrobiennes
- Physiopathologie des Infections Respiratoires
- Physiopathologie des Infections Digestives
UEB (2eme semestre) :
- SEANCES DE PRESENTATION D’ARTICLES
STAGE EN LABORATOIRE/UNITE DE SOIN

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Exemples de découvertes de molécules d’intérêt thérapeutique à
partir de sources animales.
 Analyse de documents scientifiques décrivant le processus de
conception du médicament allant de la sélection d’une source
naturelle à la commercialisation d’un médicament.
 Utilisation des structures tridimensionnelles de protéines dans la
conception de molécules d’intérêt thérapeutique.
 Description des principaux outils expérimentaux et numériques
permettant la résolution de structures tridimensionnelles de
protéines
 Chimie médicinale, Principes de bases et Relations Structures
Activités (RSA). Exemples de découvertes de nouveaux principes
actifs par criblage, docking, connaissance des civilisations
anciennes, à partir de médicaments existants, par hasard
(sérendipité)… Principales interactions entre un Principe Actif et sa
cible biologique et optimisations, logP, isostérie et bio-isostérie,
Règle des 5 de Lipinski…
 Utilisation des outils informatiques afin de comprendre la démarche
des chercheurs pour concevoir un nouveau principe actif (recherche
bibliographique, dessin de molécules, interprétation d’un spectre
RMN 1H).
 Préparation d’une nouvelle molécule et caractérisation par RMN 1H.

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IMPACT DE L’ENVIRONNEMENT SUR LA SANTE
- Epidémiologie environnementale
- Notion, définition et perception du risque
- Effets toxicologiques environnementaux sur la santé

LES TECHNIQUES D’ANALYSE ET DE GESTION DU RISQUE
- Les méthodes d’évaluation du risque sanitaire
- Les différentes structures et outils de toxicovigilance sanitaire
- Définition des normes sanitaires et des stratégies de contrôle

LES GRANDS RISQUES ENVIRONNEMENTAUX
- Risques sanitaires liés à l’alimentation, à la qualité de l’air, à la qualité
de l’eau, à la contamination des sols
- Rayonnements ionisants et non-ionisants (radioactivité, CEM…)
- Risques chimiques (perturbateurs endocriniens, pesticides, amiante,
dioxines…)
- Risques infectieux (antibiorésistance, Lyme, prions…)

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Semestre 1 (25h CM, 5h ED)
Exploration du SNC
Physiopathologies et stratégies thérapeutiques des maladies
- psychiatriques : anxiété, dépression, schizophrénie
- neurologiques : AVC, migraines, épilepsies, SEP
- neurodégénératives : Alzheimer, Parkinson
Cas cliniques et analyses critiques d’ordonnances (ED)
Semestre 2 (25h CM, 5h ED)
Modèles-animaux (Face, construct and predictive validities) des
pathologies psychiatriques, neurologiques et neurodégénératives
Potentialisation à long terme, modèle moléculaire de l’apprentissage
Neuroplasticité
Neurogénèse
Facteurs neurotrophiques (Brain-derived neurotrophic factor)
Exercice physique et santé cérébrale
Régulation du débit sanguin cérébral
Barrières cérébrales
Introduction à l’expérimentation animale
Analyses critiques de protocoles expérimentaux (ED)

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Outils d'analyses biologiques moléculaires haut débit:
 Approches d’étude des gènes, de leur expression et de leur régulation différents niveaux d’études : génomique, trancriptomique,- protéomique, métabolomique
 Processus de régulation des gènes et de leur expression :
épigénétique: modification du génome (méthylation, code histone), régulation transcriptionnelles, post-transcriptionnelles, post-traductionnelles, ARN interférent, CRISPR-CAS9.
 Structure/fonction des protéines, interaction ligand/protéines :
fluorimétrie, microcalorimétrie, dichroïsme circulaire, diffusion de lumière.
Modèles d’études et technologies pour l’innovation thérapeutique :
 protéines thérapeutiques recombinantes
 modèles in-vivo, in-vitro, ex-vivo cytométrie en flux, imagerie in vivo

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* Introduction aux Nanosciences (4h) : Principes et concepts. Nanotechnologies et vie quotidienne. Etat des recherches actuelles dans le domaine de la Santé.
* Nanobiosciences (4h) : Nouvelles stratégies d’assemblages supramoléculaires – Microfluidique – Vers la réalisation de biopuces dynamiques et d'outils de diagnostic.
* Introduction aux Nanotechnologies (6h) : Champ de recherche sur le développement, la caractérisation, la fabrication et les applications de dispositifs – Approche bottom-up – Approche
top-down. Enjeux. Risques. Aspects éthiques.
* Nano-objets - nano-matériaux - nanosystèmes (8h) : Synthèse – Nanoparticules - Biomatériau – Smart devices – Aspect biocompatibilité.
* Outils de caractérisation à l’échelle nanométrique (6h) : Microscopies haute résolution et spectroscopies SERS, IR associées. Applications.
* Spectroscopies appliquées à la détection de molécules et de stress (6h) : IRM et RMN appliquées dans le domaine de la santé.
* Nanotechnologies pour le diagnostic précoce du cancer (4h) : Rôle des nanomatériaux en imagerie in vivo.
* Nanotechnologies pour la conception de médicaments (6h) Nouveaux concepts physico-chimiques – Applications au niveau de la recherche dans la protection des molécules actives, le
contrôle de la libération dans le temps.
* Travaux pratiques sur les plateformes technologiques (12h) : Etude d’un cas de recherche. Découverte des microscopies AFM, SEM et TEM, technique LB. Travaux pratiques sur un instrument d’analyse par groupe de 5 étudiants. Rapport de TP (20h) Travail personnel de rédaction de compte-rendu de travaux réalisés au sein des plateformes technologiques et protéomique.

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