UE1 Outils, acquisitions et analyses de données

Cet enseignement présentera des outils et méthodologies utilisés en recherche dans les domaines de la génétique et génomique, de l’étude des protéiques, des biotechnologies en biologie et particulièrement en sciences végétales  

Programme :

Cours magistraux (23h, dont 11h mutualisées M2 SCM) 

Manipulation et étude des gènes et du génome  

-Génomique et métagénomique  

-Genome editing  

-Gene silencing  

-Génétique inverse focalisée sur le Tilling  

Phylogénie  

Expression hétérologue chez la levure 

Méthodes d’étude des protéines 

-Nouveaux défis de la protéomique  

-Outils d’analyse du trafic membranaire 

-Interactions protéiques  

Techniques élémentaires d'analyse de flux de C et de N  

Taxonomie conventionnelle et moléculaire  

Travaux dirigés (15h) 

Exercices sous forme d’analyse de données de publications sur thèmes de CM 

Planification d’expériences, modèles cellulaires et plantes 

Visite de plateformes : 4PMI, DimaCell, Génosol 

Ateliers d’analyses de flux C & N  

Travaux pratiques (12h) 

Expression hétérologue chez la levure 

Taxonomie moléculaire  

TILLING et identification de mutations ponctuelles