Master Biodiversité, écologie et évolution - Nouvelle formation

Cet enseignement permettra de maitriser le choix et la mise en œuvre des méthodes/outils de base d’acquisition et d’analyse des données liées à la biodiversité (plans d’expérience et d’échantillonnage, descripteurs numériques et graphiques des données, analyses uni- et bi-variées et taille d’effet, modèles linéaires). Il fournira également les outils de base pour décrire la biodiversité (écologie quantitative) et les données géoréférencées (logiciels et méthodes de cartographie et d’analyses spatiales). L’objectif général sera de permettre l’utilisation des outils d’analyse présentés de manière autonome, en exerçant un regard critique sur leurs intérêts et limites.

Cet enseignement sera principalement constitué de travaux dirigés et pratiques, durant lesquels les concepts théoriques et outils de l’analyses seront utilisés en situations réelles. Ces situations permettront de maitriser en autonomie les bases des logiciels R et QGIS.

Le bloc est composé de trois modules obligatoires :

 Module “Biostatistiques” (2 ECTS)

plans d’expériences, statistiques descriptives, analyses uni et bivariées, taille d’effet, modèles linéaires. Enseignement intégré avec le logiciel R

 Module "Écologie quantitative” (2 ECTS)

Les indicateurs de Biodiversité

 Module “Systèmes d’Information Géographique” (2 ECTS)

Intérêts et usages des SIG, mise en application avec le logiciel QGIS.

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Module “Biostatistiques” (2 ECTS)

plans d’expériences, statistiques descriptives, analyses uni et bivariées, taille d’effet, modèles linéaires. Enseignement intégré avec le logiciel R

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Les indicateurs de Biodiversité

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Intérêts et usages des SIG, mise en application avec le logiciel QGIS.

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Cet enseignement vise à maitriser les ressources (concepts d’écologie évolutive et outils bibliographiques) nécessaires pour appréhender la complexité des conséquences des changements anthropiques sur la biodiversité. Les concepts d’écologie et d’évolution seront abordés au travers du prisme des changements anthropiques. Afin d’appréhender ces problématiques dans leur intégralité, et pour les replacer dans un contexte plus large, un panorama des acteurs de la biodiversité (monde académique et gestionnaires), des politiques (régionales, nationales, européennes), et des outils de gestion (tels que ZNIEFF, PNR, Natura 2000) sera également présenté. L’accent sera mis sur la complémentarité des approches (fondamentales et appliquées et des niveaux écologiques) et des acteurs (chercheur, gestionnaires, décideurs politiques). Une formation sur la maitrise des outils et méthodes de recherche bibliographique complétera cet enseignement. Il permettra la réalisation d’un état de l’art sur une problématique en lien avec les changements anthropiques. Ce bloc intègre également une école de terrain (5 jours) qui s’appuiera sur plusieurs mises en situation concrètes permettant de mobiliser des compétences complexes pour répondre à des questions de recherche et de gestion de la biodiversité.

Ce bloc est composé de 4 modules obligatoires :

Module “Ecole de Terrain” (3 ECTS)

Mises en situations concrètes durant 5 jours permettant d’identifier les compétences et ressources nécessaires pour la mise en place et le suivi d’un projet de recherche et/ou de gestion de la biodiversité.

Présentations concrètes des acteurs et de la réalisation de plans de gestion de la biodiversité.

Module “Ecologie évolutive” (4 ECTS)

Ethique et épistémologie de l'écologie et de l'environnement

Modules de mise à niveau en écologie et évolution, illustrant les réponses individuelles (traits d’histoire de vie et comportement), populationnelles (dynamique et génétique des populations), des communautés et des écosystèmes (structure et fonctionnement) aux changements anthropiques, et conséquences sur les dynamiques évolutives (co-évolution, adaptation, spéciation, extinction, pièges évolutifs et déplacement de caractères), dynamique éco-évolutive.

Module “Acteurs, politiques, et outils de gestion” (3 ECTS)

Panorama des acteurs de la biodiversités (monde académique et gestionnaires), des politiques (régionales, nationales, européennes), et des outils de gestion (ZNIEFF, PNR, Natura2000…).

Module “Bibliographie et état de l’art” (3 ECTS)

Utilisation des outils nécessaires à la contextualisation d’une problématique liée à la biodiversité (démarche et outils bibliographique, réalisation d’une synthèse bibliographique).

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Module “Ecole de Terrain” (3 ECTS)

Mises en situations concrètes durant 5 jours permettant d’identifier les compétences et ressources nécessaires pour la mise en place et le suivi d’un projet de recherche et/ou de gestion de la biodiversité.

Présentations concrètes des acteurs et de la réalisation de plans de gestion de la biodiversité.

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Module “Ecologie évolutive” (4 ECTS)

Ethique et épistémologie de l'écologie et de l'environnement

Modules de mise à niveau en écologie et évolution, illustrant les réponses individuelles (traits d’histoire de vie et comportement), populationnelles (dynamique et génétique des populations), des communautés et des écosystèmes (structure et fonctionnement) aux changements anthropiques, et conséquences sur les dynamiques évolutives (co-évolution, adaptation, spéciation, extinction, pièges évolutifs et déplacement de caractères), dynamique éco-évolutive.

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Module “Acteurs, politiques, et outils de gestion” (3 ECTS)

Panorama des acteurs de la biodiversités (monde académique et gestionnaires), des politiques (régionales, nationales, européennes), et des outils de gestion (ZNIEFF, PNR, Natura2000…).

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Module “Bibliographie et état de l’art” (3 ECTS)

Utilisation des outils nécessaires à la contextualisation d’une problématique liée à la biodiversité (démarche et outils bibliographique, réalisation d’une synthèse bibliographique).

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L’objectif de cet enseignement est de maitriser les principaux canaux de diffusion de la connaissance scientifique auprès de publics variés (des spécialistes au grand public). Cet enseignement sera basé sur une diversité de mises en situations qui aboutiront à la production de différents supports et réalisations (rédaction d’un article scientifique, d’un article de vulgarisation, réalisation d’un poster, et d’une présentation orale basée sur un diaporama). Les intérêts et spécificités de chaque support de diffusion seront vus et illustrés. Cet enseignement sera abordé au travers de plusieurs réalisations concrètes, et par l’évaluation par les pairs. Ces mises en situations seront l’occasion de renforcer la maitrise de la langue anglaise.

 Ce bloc intègre également une formation à la création d’un porte-folio, qui sera construit tout au long de la formation de Master (1ère et 2ème année). Cet outil permettra de valoriser la diversité des compétences acquises durant la formation, et aidera à l’insertion professionnelle et/ou à la poursuite des études en thèse.

Ce bloc est composé de deux modules obligatoires :

 Module “Communication scientifique” (3 ECTS)

La fiabilité des écrits scientifiques, les processus de fabrication, d’évaluation, et de publication.

La rédaction d’un article scientifique et d’un article de vulgarisation.

La présentation orale, la production d’un diaporama et d’un poster scientifique.

Module “Porte-folio” (2 ECTS)

Initiation à la production d’un porte-folio permettant de synthétiser et valoriser l’ensemble des compétences qui seront acquises durant les deux années de master.

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Module “Communication scientifique” (3 ECTS)

La fiabilité des écrits scientifiques, les processus de fabrication, d’évaluation, et de publication.

 La rédaction d’un article scientifique et d’un article de vulgarisation.

 La présentation orale, la production d’un diaporama et d’un poster scientifique.

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Module “Porte-folio” (2 ECTS)

Initiation à la production d’un porte-folio permettant de synthétiser et valoriser l’ensemble des compétences qui seront acquises durant les deux années de master

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Cet enseignement est divisé en deux phases qui se déroulent au S1 au S2 (voir S2_OB_PROJ). L’ensemble de ces deux blocs constitue une situation d’apprentissage et d’évaluation (SAÉ) au cours de laquelle les étudiant.e.s seront confronté.e.s à une situation authentique et complexe, liée à leur futur contexte professionnel. Cette SAÉ permettra le développement et l’évaluation de compétences à travers l’action.

A l’issu des enseignements des deux blocs, les étudiant.e.s devront maitriser une diversité de ressources ainsi que leur mobilisation en situations authentiques, en faisant preuve d’une attitude professionnelle. Ainsi, deux projets en lien des problématiques de Biodiversité seront réalisés par les étudiant.e.s, avec l’appui d’enseignants : i) un projet visant à traiter une question de recherche et ii) un projet répondant à un besoin réel d’une structure privée ou publique.  

L’ampleur et l’exigence de ces projets nécessiteront un travail en groupes qui mixeront des étudiant.e.s du master BCA et des étudiant.e.s de la licence SVTE.

Ce premier bloc constitue la phase de conception des projets, qui seront réalisés au deuxième semestre.

Programme :

-  Réception de la commande / problématique de recherche

 - Elaboration du cahier des charges

 - Elaboration du protocole d’expérience/d’échantillonnage

 - Elaboration du plan de financement

 - Planification du déroulé des opérations

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-  Réception de la commande / problématique de recherche

 - Elaboration du cahier des charges

 - Elaboration du protocole d’expérience/d’échantillonnage

 - Elaboration du plan de financement

 - Planification du déroulé des opérations

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Cet enseignement a pour objectif d’identifier et articuler les ressources nécessaires pour appréhender, dans leur globalité, les effets des principales menaces actuelles de la Biodiversité (voir programme). Dans un contexte donné, l’étudiant sera en mesure d’identifier et mettre en lien i) les types (ex: physiologique, comportementale, génétique) et les niveaux (individu, population, communauté, écosystème) de réponses pertinents afin de comprendre les conséquences des changements anthropiques sur la Biodiversité. Dans un deuxième temps, il s’agira de proposer des solutions qui permettraient de tamponner ces effets, en tenant compte des enjeux, des contraintes et les conflits potentiels d’usages et d’usagers.

 Cet enseignement pluridisciplinaire, reposera sur l'intervention i) de chercheurs sur des aspects fondamentaux et appliqués en lien avec le thème abordé et ii) de professionnels de la gestion de la biodiversité et de l’emménagement du territoire, dans le but de favoriser la diversité des approches et des points de vue. En parallèle, des séminaires seront donnés par des professionnels tout au long du semestre. Ils permettront par exemple d’illustrer par des cas concrets la problématique des conflits d’usages et d’usagers autour d’une ressource (ex l’eau), d’un territoire (ex territoires agro-pastoraux), ou d’un intérêt (ex partenariat recherche-entreprise privée), ainsi que des pistes de gestion de ces conflits.

Ce bloc est composé de 4 modules obligatoires auxquels s’ajoutent des séminaires organisés tout au long du semestre.

Programme :

Module “Agriculture” (2 ECTS)

Module “Invasions biologiques” (2 ECTS)

Module “Changements climatiques” (2 ECTS)

Modules “Urbanisation et fragmentation des habitats” (2 ECTS)

Module “Séminaires” (2 ECTS)

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Ce bloc est composé de 4 modules obligatoires auxquels s’ajoutent des séminaires organisés tout au long du semestre.

Module “Agriculture” (2 ECTS)

Module “Invasions biologiques” (2 ECTS)

Module “Changements climatiques” (2 ECTS)

Modules “Urbanisation et fragmentation des habitats” (2 ECTS)

Module “Séminaires” (2 ECTS)

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Ce bloc est composé de 4 modules obligatoires auxquels s’ajoutent des séminaires organisés tout au long du semestre.

Module “Agriculture” (2 ECTS)

Module “Invasions biologiques” (2 ECTS)

Module “Changements climatiques” (2 ECTS)

Modules “Urbanisation et fragmentation des habitats” (2 ECTS)

Module “Séminaires” (2 ECTS)

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Ce bloc est composé de 4 modules obligatoires auxquels s’ajoutent des séminaires organisés tout au long du semestre.

 Module “Agriculture” (2 ECTS)

Module “Invasions biologiques” (2 ECTS)

Module “Changements climatiques” (2 ECTS)

Modules “Urbanisation et fragmentation des habitats” (2 ECTS)

Module “Séminaires” (2 ECTS)

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Ce bloc est composé de 4 modules obligatoires auxquels s’ajoutent des séminaires organisés tout au long du semestre.

Module “Agriculture” (2 ECTS)

Module “Invasions biologiques” (2 ECTS)

Module “Changements climatiques” (2 ECTS)

Modules “Urbanisation et fragmentation des habitats” (2 ECTS)

Module “Séminaires” (2 ECTS)

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Cet enseignement est composé de modules optionnels (3 modules de 20h à choisir) qui permettront d’aborder différents outils et méthodes de caractérisation et de quantification de la biodiversité. En fonction des particularités des objets d’études considérés, ces modules optionnels illustreront la diversité des techniques, outils et méthodes que l’on peut utiliser pour générer des données liées à la biodiversité, et ce, à tous les niveaux écologiques. Cet enseignement donnera les bases théoriques et donnera l’occasion de mettre en pratique les outils présentés.

Ce bloc est composé de plusieurs modules optionnels (3 à choisir, pour 6 ECTS au total) parmi une liste pouvant être amenée à évoluer selon les domaines d’expertise des intervenants, des demandes des étudiants, ainsi que des besoins identifiés par les professionnels de la biodiversité, qu’ils soient chercheurs ou gestionnaires.

 Liste non exhaustive des modules optionnels :

• Expertise naturaliste et techniques d’inventaires
• Outils de phénotypage (comportement, physiologie, immunité)
• Morphométrie et imagerie 3D
• Outils d’écologie moléculaire et isotopie
• Programmation R/python, DoItYourself, Robotique et capteurs environnementaux

Systèmes d’Information Géographique

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Ce bloc est composé de plusieurs modules optionnels (3 à choisir, pour 6 ECTS au total) parmi une liste pouvant être amenée à évoluer selon les domaines d’expertise des intervenants, des demandes des étudiants, ainsi que des besoins identifiés par les professionnels de la biodiversité, qu’ils soient chercheurs ou gestionnaires.

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Ce bloc est composé de plusieurs modules optionnels (3 à choisir, pour 6 ECTS au total) parmi une liste pouvant être amenée à évoluer selon les domaines d’expertise des intervenants, des demandes des étudiants, ainsi que des besoins identifiés par les professionnels de la biodiversité, qu’ils soient chercheurs ou gestionnaires.

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Ce bloc est composé de plusieurs modules optionnels (3 à choisir, pour 6 ECTS au total) parmi une liste pouvant être amenée à évoluer selon les domaines d’expertise des intervenants, des demandes des étudiants, ainsi que des besoins identifiés par les professionnels de la biodiversité, qu’ils soient chercheurs ou gestionnaires.

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Ce bloc est composé de plusieurs modules optionnels (3 à choisir, pour 6 ECTS au total) parmi une liste pouvant être amenée à évoluer selon les domaines d’expertise des intervenants, des demandes des étudiants, ainsi que des besoins identifiés par les professionnels de la biodiversité, qu’ils soient chercheurs ou gestionnaires.

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Ce bloc est composé de plusieurs modules optionnels (3 à choisir, pour 6 ECTS au total) parmi une liste pouvant être amenée à évoluer selon les domaines d’expertise des intervenants, des demandes des étudiants, ainsi que des besoins identifiés par les professionnels de la biodiversité, qu’ils soient chercheurs ou gestionnaires.

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Ce bloc est composé de plusieurs modules optionnels (3 à choisir, pour 6 ECTS au total) parmi une liste pouvant être amenée à évoluer selon les domaines d’expertise des intervenants, des demandes des étudiants, ainsi que des besoins identifiés par les professionnels de la biodiversité, qu’ils soient chercheurs ou gestionnaires.

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Ce bloc est composé de plusieurs modules optionnels (3 à choisir, pour 6 ECTS au total) parmi une liste pouvant être amenée à évoluer selon les domaines d’expertise des intervenants, des demandes des étudiants, ainsi que des besoins identifiés par les professionnels de la biodiversité, qu’ils soient chercheurs ou gestionnaires.

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Cet enseignement est divisé en deux phases qui se déroulent au S1 au S2 (voir S1_OB_PROJ). L’ensemble de ces deux blocs constitue une situation d’apprentissage et d’évaluation (SAÉ) au cours de laquelle les étudiant.e.s seront confronté.e.s à une situation authentique et complexe, liée à leur futur contexte professionnel. Cette SAÉ permettra le développement et l’évaluation de compétences à travers l’action.  

A l’issu des enseigments des deux blocs, les étudiant.e.s devront maitriser une diversité de ressources ainsi que leur mobilisation en situations authentiques, en faisant preuve d’une attitude professionnelle. Ainsi, deux projets en lien des problématiques de Biodiversité seront réalisés par les étudiant.e.s, avec l’appui d’enseignants : i) un projet visant à traiter une question de recherche et ii) un projet répondant à un besoin réel d’une structure privée ou publique.   

L’ampleur et l’exigence de ces projets nécessiteront un travail en groupes qui mixeront des étudiant.e.s du master BCA et des étudiant.e.s de la licence SVTE.  

Ce deuxième bloc constitue la phase de réalisation des projets qui auront été initiés au premier semestre.

Programme :

- Mise en œuvre du protocole d’échantillonnage / d’expérience

- Analyse des données

- Restitutions orale et écrite

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- Mise en œuvre du protocole d’échantillonnage / d’expérience

- Analyse des données

- Restitutions orale et écrite

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Ce bloc est composé d’un stage de 8 semaines, effectué sur un sujet en lien avec la biodiversité au sens large. De par l’immersion dans une structure professionnelle, l’objectif du stage est de mobiliser les compétences acquises au paravent dans le cursus. Ce bloc vise à développer des compétences spécifiques liées au sujet du stage et d’affiner ou donner une nouvelle direction au projet professionnel de l’étudiant.e. Le stage peut être réalisé dans une ou des structures telles que des associations naturalistes et des ONG, des bureaux d'études, des collectivités territoriales (e.g. communautés de communes et grandes agglomérations, syndicats inter-communaux), des PN, PNR, RN, des conservatoires, des services de l'Etat et Offices nationaux (DREAL, ONCFS, ONEMA), des fédérations départementales ou régionales de chasse ou de pêche, des laboratoires de recherches (CNRS, Universités, INRAE), en France ou à l’étranger. Le sujet du stage devra être validé par l'équipe pédagogique qui évaluera la pertinence de la structure d’accueil et du sujet, au regard du projet professionnel de l’étudiant.e et des finalités de la formation. Chaque étudiant.e sera suivi par un tuteur pédagogique universitaire qui veillera au bon déroulement du stage de l'étudiant.e.

Enfin, pour clôturer ce bloc, une journée de retour d’expériences sera organisée sous forme de tables rondes afin de permettre des échanges plus informels entre étudiants et avec les professionnels.

Programme :

- Réalisation du stage dans la structure (8 semaines sur une période de 3 mois)

- Rédaction du mémoire de stage (4 ECTS)

- Soutenance orale devant un jury (4 ECTS)

- Journée de retour d’expériences et tables rondes 

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