Modules à choix en BIOCHIMIE et BIOLOGIE MOLECULAIRE :

Ce module participe de la spécialité :

BBM (Biochimie et biologie moléculaire )

Programme :

Réactivité des composés organiques monofonctionnels  

 Approches thermodynamique et cinétique ; maitrise des intermédiaires réactionnels. 

Principales classes de réactions : substitution nucléophile, élimination, addition nucléophile (illustration avec synthèse de médicaments, de produits naturels…) 

Concepts généraux de bioénergétique, additivité des variations d’énergie libre et réactions couplées, ATP/autres composés comportant des groupes à haut potentiel de transfert. 

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Ce module participe pour l'élaboration d'une spécialité en :
BBM (Biochimie et biologie moléculaire ) 
SVg (Sciences du Végétal)
SVT ME (Métiers de l'Enseignement en SVT)
PCB (Préparation au concours B) 

Ce module est également suivi par les étudiants de CYPI

La biochimie métabolique aborde les grands cycles métaboliques nécessaires au fonctionnement du vivant. Dans ce module d’initiation, les principales voies métaboliques de dégradation des molécules pour en tirer de l’énergie (catabolisme) sont décrites. Des liens sont effectués avec la biologie cellulaire, la physiologie, l’activité physique et sportive et les pathologies liées au dysfonctionnement du métabolisme. 

Des notions d’enzymologies sont également apportées en soutien des explications de régulation métabolique. 

Programme :

Cours magistraux

Les voies métaboliques décrites sont : 

-la régulation enzymatique des voies principales, cinétiques michaeliennes et allostériques, inhibiteurs compétitifs, non compétitifs et incompétitifs, en vue de la compréhension des cycles métaboliques

-Introduction générale sur les réserves et les besoins métaboliques, relations avec les activités sportives, réserves mobilisées, type de métabolisme mis en place

- le métabolisme des sucres (glycolyse, glycogénogenèse et glycogénolyse)

- le métabolisme des protéines et des acides aminés, leur biosynthèse et leur catabolisme (transamination, désamination oxydative, décarboxylation)

- le métabolisme des lipides (catabolisme avec les différentes bêta-oxydations)

- le devenir de l’acétyl-CoA et la production d’énergie (fonction catabolique du cycle de Krebs, chaine respiratoire mitochondriale, phosphorylation oxydative)

- l’étude de l’interrelation entre les différentes voies métaboliques

Travaux dirigés : Exercices d’approfondissement des CM avec exemples pratiques, suivis de métabolites dans les voies métaboliques étudiées. 

Travaux pratiques : Activité enzymatique de la lactate déshydrogénase, une enzyme du métabolisme anaérobie (fermentation lactique), en présence ou non d’inhibiteur. 

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Ce module participe de la spécialité :  BBM (Biochimie et Biologie moléculaire )

Le cours vise à fournir une base solide pour l'application des principes de biophysique dans l'étude des systèmes biologiques. Les étudiants développeront une compréhension approfondie des mécanismes de transport et de diffusion en biologie, de la mécanique des fluides, des techniques de caractérisation utilisées en biophysique, ainsi que des concepts fondamentaux de la thermodynamique.

Cours :  

TRANSPORT ET DIFFUSION EN BIOLOGIE  

- Mécanismes de transport et de diffusion ( mouvements des ions , courant ionique), Transport actif (pompe) et passif (canaux) dans les membranes biologiques 

  - Modèles mathématiques pour décrire le transport et la diffusion ( potentiel électrochimique loi de Nernst - loi de Goldman ) 

 MECANIQUE DES FLUIDES  

La statique (Loi de Pascal , Pression atmosphérique, Mesure de la pression, Flottabilité et immersion), La dynamique (Écoulements laminaires et turbulents, perte de charge dans les conduites) 

 TECHNIQUES DE CARACTERISATION  

   - Microscopie électronique, optique / microscopie de fluorescence / à force atomique (AFM) 

   - Techniques d'imagerie par résonance magnétique nucléaire ( RMN ) 

   - spectroscopie infrarouge / Raman,  Calorimétrie, Voltamétrie,  Résonance plasmonique ( SPR ) 

THERMODYNAMIQUE 

-    Introduction (États thermodynamiques ,Première loi) 

-  Énergie thermique (Définition,  Unités, Transferts de chaleur) 

-  Systèmes thermodynamiques 

Travaux dirigés (8+1h) 

 Les TDS seront appliqués 

 - à la cellule nerveuse , au système cardiaque et aux techniques d’enregistrement des signaux électriques. 

-  aux systèmes circulatoires , au transport de nutriments et de déchets, aux  mécanismes d'écoulements en milieux aquatiques , aux écoulements sanguins dans les vaisseaux 

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Ce module participe de la spécialité :

•  BBM (Biochimie et biologie moléculaire )

Il est suivi par les étudiants de CYPI

La biochimie métabolique aborde les grands cycles métaboliques nécessaires au fonctionnement du vivant.  

Dans ce module de maitrise, les principales voies métaboliques de synthèse de molécules (anabolisme), sont décrites. Une fois le module d’initiation acquis, des voies complémentaires seront abordées. Leurs liens avec la physiologie, la physiopathologie et les voies précédemment décrites seront expliqués. 

Programme :

Cours magistraux :

Les voies métaboliques décrites sont : 

- le métabolisme des sucres (voie des pentoses, néoglucogenèse)

- le métabolisme des protéines et des acides aminés, leur biosynthèse et leur catabolisme (aldolisation, cycle de l’urée, anabolisme des amino-acides) 

- le métabolisme des lipides (biosynthèse des acides gras, régulation de la cétogenèse…)

- le devenir de l’acétyl-CoA et la production d’énergie (fonction anabolique du cycle de Krebs)

- l’étude de l’interrelation entre les différentes voies métaboliques)

Travaux dirigés

Exercices d’approfondissement des CM avec exemples pratiques et situations pathologiques, suivis de métabolites dans les voies métaboliques étudiées

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